Les meilleurs logiciels de comptabilité pour petites entreprises en 2026
Le bon logiciel de comptabilité ne promet pas de supprimer le comptable : il répartit clairement le travail entre vous, votre équipe et votre cabinet. Depuis le 1er septembre 2026, il doit aussi s’inscrire dans la facturation électronique, car toute entreprise assujettie à la TVA doit pouvoir recevoir ses factures par une plateforme agréée.
En pratique. Après un appel manqué renvoyé vers Rappli, l’appelant entend votre accueil. Avec le « SMS avec formulaire », il peut ensuite recevoir un lien vers un formulaire, si son numéro et vos réglages le permettent ; ce SMS a pour expéditeur « Rappli » et il ne peut pas y répondre. S’il transmet sa demande, vous la retrouvez dans votre tableau de bord. Rappli n’intervient pas dans la comptabilité : il sert en amont, quand un client appelle et que vous ne pouvez pas décrocher, bien avant qu’une facture existe.
6 solutions à comparer en 2026
Ce que montre le tableau : le public visé, le prix d’entrée affiché par chaque éditeur le 29 septembre 2026 et sa présence sur la liste des plateformes agréées de la DGFiP, mise à jour le 22 septembre 2026. Les prix changent souvent : vérifiez-les avant de souscrire.
| Rang | Solution | Pour qui | Prix d’entrée relevé | Plateforme agréée |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Pennylane | TPE avec un cabinet connecté | Dès 7 € HT par mois ; gratuit pour une micro-entreprise | Oui |
| 2 | Indy | Indépendant ou petite société, parcours guidé | Socle gratuit ; bilan d’une société dès 49 € HT par mois en annuel | Oui |
| 3 | EBP Comptabilité | Comptabilité structurée, éditeur historique | Sur devis | Annoncée par l’éditeur, nom EBP absent de la liste |
| 4 | Sage 50 | Gestion commerciale et comptabilité, jusqu’à 3 utilisateurs | Pack Comptabilité dès 21 € HT par mois | Oui, au nom de Sage |
| 5 | Tiime | Collecte mobile et cabinet | Offre gratuite ; payant dès 9,99 € HT par mois en annuel (offre Initial) | Oui |
| 6 | Odoo Comptabilité | Entreprise prête à configurer un ERP | Une application gratuite ; plans par utilisateur | Oui |
Notre méthode de classement
Public visé : Les indépendants, TPE et petites sociétés qui veulent tenir ou préparer leur comptabilité avec un périmètre adapté à leur statut.
Construction du classement : Le rang suit la couverture d’une petite entreprise avec ou sans cabinet : statuts pris en charge, collaboration avec l’expert-comptable et circuit des factures, puis prix d’entrée. Pennylane et Indy couvrent le plus de situations sans projet d’installation ; EBP et Sage 50 visent une gestion plus structurée ; Tiime s’appuie beaucoup sur le cabinet ; Odoo exige un vrai paramétrage. Le rang ne remplace pas un essai sur vos propres pièces.
Périmètre distinctif : Ce classement traite la comptabilité d’une petite entreprise. Il ne remplace ni les classements de facturation seule, de notes de frais ou de trésorerie prévisionnelle, ni le comparatif des logiciels de devis et factures pour auto-entrepreneurs, mieux adapté à une micro-entreprise.
Traçabilité éditoriale : Pages produit et tarifs des six éditeurs, et liste officielle des plateformes agréées, relues le 29 septembre 2026. Aucun éditeur ne verse de commission à Rappli et aucun lien n’est affilié. Les offres évoluent souvent : confirmez fonctions, prix et conditions avant de vous engager.
Indépendance : Rappli, qui édite ce blog, n’est jamais classé.
- Compatibilité avec le statut et le régime
- Répartition avec le cabinet
- Achats, ventes et pièces
- Facturation électronique et interopérabilité
- Export et continuité
Analyse des 6 solutions retenues
Pennylane
Pour qui : Une TPE qui veut réunir gestion financière et collaboration avec son cabinet.
Ce qui compte pour une TPE : Pennylane centralise ventes, achats, banque, pièces et comptabilité dans une base partagée avec l’expert-comptable, et inclut la facturation électronique dans tous ses plans.
Ce que dit la source officielle : La page tarifs, relevée le 29 septembre 2026, annonce des plans dès 7 € HT par mois (Starter, avec le compte pro Pennylane) et un plan gratuit réservé aux micro-entreprises ; Pennylane figure sur la liste DGFiP des plateformes agréées.
Limite à connaître : Pennylane précise qu’il n’est pas un cabinet d’expertise comptable : la production des comptes et des déclarations reste à organiser avec un professionnel, dont le rôle et le coût sont à clarifier dès le départ.
Indy
Pour qui : Un indépendant ou une petite société qui veut un parcours guidé jusqu’au bilan.
Ce qui compte pour une TPE : Indy couvre la micro-entreprise, l’entreprise individuelle, la SCI et les sociétés, avec un socle gratuit qui comprend la facturation électronique et la comptabilité automatisée.
Ce que dit la source officielle : La page tarifs, relevée le 29 septembre 2026, affiche pour une SAS, SASU, SARL ou EURL la génération du bilan dès 49 € HT par mois en facturation annuelle (588 € HT par an) et un bilan attesté par un expert-comptable partenaire à 108 € HT par mois (1 296 € HT par an) ; Indy est une plateforme agréée.
Limite à connaître : Pour une société, le bilan relève des formules payantes et sa validation par un expert-comptable partenaire d’une formule supérieure ; vérifiez aussi la paie, les stocks et les cas particuliers avant de migrer.
EBP Comptabilité
Pour qui : Une petite entreprise qui veut une comptabilité structurée et un éditeur historique.
Ce qui compte pour une TPE : L’offre EBP Comptabilité ACTIV couvre la comptabilisation automatique des factures, le rapprochement bancaire, les relances, les états comptables, les clôtures et la déclaration de TVA.
Ce que dit la source officielle : La page officielle, relevée le 29 septembre 2026, annonce la réception des factures électroniques via la plateforme agréée de l’éditeur et présente ses offres de comptabilité sur devis.
Limite à connaître : Les offres ACTIV et PRO sont sur devis, et le nom EBP n’apparaît pas tel quel sur la liste DGFiP des plateformes agréées du 22 septembre 2026 : demandez sous quel nom la plateforme annoncée est immatriculée.
Sage 50
Pour qui : Une TPE qui veut rapprocher gestion commerciale et comptabilité, jusqu’à trois utilisateurs.
Ce qui compte pour une TPE : Sage 50 relie comptabilité, devis, factures, stocks et trésorerie ; ses packs Comptabilité, Gestion commerciale et Comptabilité + Facturation vont jusqu’à trois utilisateurs.
Ce que dit la source officielle : La page officielle, relevée le 29 septembre 2026, affiche le pack Comptabilité à partir de 21 € HT par mois, avec 30 jours d’essai gratuit ; Sage figure sur la liste DGFiP des plateformes agréées.
Limite à connaître : Le paramétrage et la migration engagent davantage qu’une application légère ; choisissez le bon pack et testez le quotidien des utilisateurs qui ne sont pas comptables.
Tiime
Pour qui : Un dirigeant qui privilégie la collecte mobile et la relation avec son cabinet.
Ce qui compte pour une TPE : Tiime réunit factures, justificatifs, banque et partage avec l’expert-comptable dans une application mobile, avec une offre gratuite de facturation électronique via sa plateforme agréée.
Ce que dit la source officielle : La page tarifs, relevée le 29 septembre 2026, présente une offre Free gratuite et des offres payantes en facturation annuelle, dont le prix varie selon le nombre de salariés : dès 9,99 € HT par mois pour Initial (micro-entreprise ou 0 à 1 salarié, compte pro Tiime obligatoire), dès 17,99 € HT par mois pour Smart, première offre à inclure la collaboration complète avec l’expert-comptable ; 60 jours d’essai, et Tiime figure sur la liste DGFiP.
Limite à connaître : Distinguez les fonctions accessibles directement de celles fournies par un cabinet ou une offre associée, notamment pour la production déclarative.
Odoo Comptabilité
Pour qui : Une entreprise qui veut intégrer la comptabilité à un ERP modulaire.
Ce qui compte pour une TPE : Odoo devient pertinent lorsque ventes, achats, stock, projets et comptabilité doivent partager le même référentiel.
Ce que dit la source officielle : La page tarifs, relevée le 29 septembre 2026, rend une seule application gratuite pour un nombre illimité d’utilisateurs ; au-delà, les plans Standard et Personnalisé sont facturés par utilisateur et par mois. Odoo figure sur la liste DGFiP.
Limite à connaître : La configuration, la localisation française, les intégrations et la maintenance demandent un projet sérieux ; ce n’est pas le choix le plus simple pour tenir quelques écritures.
Quel choix selon votre situation ?
Partez de votre statut et de votre relation avec le cabinet plutôt que du rang : une micro-entreprise n’a pas besoin du même outil qu’une société avec stock.
| Situation | Choix à examiner | Pourquoi |
|---|---|---|
| Micro-entrepreneur qui tient seulement un livre des recettes | Un logiciel de facturation plutôt qu’une comptabilité complète | Factures conformes, réception électronique et livre des recettes couvrent l’essentiel de ses obligations comptables. |
| Indépendant ou petite société qui veut produire son bilan | Indy ou Tiime après contrôle d’éligibilité | Le guidage et la collecte des pièces peuvent réduire davantage le travail qu’un logiciel comptable complet. |
| TPE accompagnée par un cabinet connecté | Pennylane | Une donnée commune et des responsabilités explicites fluidifient la clôture et le pilotage. |
| Petite entreprise avec stock ou gestion commerciale structurée | EBP, Sage 50 ou Odoo | L’intégration des achats, ventes et stocks devient centrale, mais exige davantage de paramétrage. |
Pour compléter la comptabilité, comparez aussi les outils de gestion de trésorerie pour TPE et les logiciels de notes de frais pour TPE.
Les critères qui doivent vraiment départager les solutions
1. Compatibilité avec le statut et le régime
Vérifiez explicitement la forme juridique, l’imposition, la TVA, les immobilisations, les stocks et les obligations déclaratives couvertes.
2. Répartition avec le cabinet
Définissez qui collecte, catégorise, rapproche, révise et déclare, puis testez les droits et commentaires sur une période réelle.
3. Achats, ventes et pièces
Le logiciel doit relier facture, justificatif, banque, règlement et écriture sans créer plusieurs archives concurrentes.
4. Facturation électronique et interopérabilité
Vérifiez sur la liste de la DGFiP si l’éditeur est une plateforme agréée immatriculée, ou avec quelle plateforme il travaille, puis suivez une facture fournisseur reçue jusqu’à sa comptabilisation.
5. Export et continuité
Contrôlez les exports comptables et documentaires, la reprise d’historique, la sauvegarde et les conditions d’accès après résiliation.
Avant de choisir un outil, vérifiez aussi qui fera quoi. Notre guide expert-comptable obligatoire ? Micro, EI ou société explique ce que vous pouvez tenir vous-même et ce qui revient à un professionnel ; pour une micro-entreprise, les obligations comptables du micro-entrepreneur suffisent souvent à fixer le besoin. Pour le quatrième critère, le comparatif des plateformes de facturation électronique détaille les options.
Ce que Rappli complète — sans remplacer les solutions classées
Test concret pour une TPE qui choisit sa comptabilité : appelez votre ligne depuis un autre téléphone et laissez sonner sans répondre. Sur ce téléphone, vous entendez votre accueil, puis le SMS prévu arrive si son numéro et vos réglages permettent l’envoi. Cet appel crée une vraie demande, comptée dans votre volume ou votre essai ; pour contrôler seulement le renvoi d’un mobile, l’appel de vérification de votre espace Rappli n’est pas décompté. Ce test ne dit rien de votre logiciel comptable.
Limite pour ce comparatif : Rappli n’émet aucune pièce comptable, ne catégorise aucun mouvement, ne produit aucune déclaration et ne remplace ni le logiciel ni le professionnel du chiffre.
Tester deux logiciels sur un mois réel
Limitez l’essai à deux logiciels et utilisez un mois réel de pièces, avec votre expert-comptable si vous en avez un.
- Importez un mois de banque et vérifiez le rapprochement avec les factures et les justificatifs.
- Recevez une facture fournisseur électronique et suivez-la jusqu’à son écriture, sans ressaisie.
- Saisissez un achat de matériel et une facture à deux taux de TVA : le logiciel doit les classer correctement ou vous alerter.
- Donnez un accès à votre cabinet et vérifiez ce qu’il peut voir, commenter et valider.
- Exportez le FEC et le grand-livre, puis vérifiez ce que vous récupérez si vous résiliez ; le guide sur la migration des données lors d’un changement de logiciel détaille la reprise.
Sources officielles consultées le 29 septembre 2026 : Pennylane — tarifs ; Indy — tarifs ; EBP Comptabilité ; Sage 50 ; Tiime — tarifs ; Odoo — tarifs ; impots.gouv.fr — liste des plateformes agréées (mise à jour le 22 septembre 2026) ; Service Public Entreprendre — calendrier de la facturation électronique.
Questions fréquentes
Peut-on tenir seul la comptabilité de sa petite entreprise ?
Oui : aucun statut n’impose d’expert-comptable. Le dirigeant reste responsable de ses comptes et de ses déclarations, et si la tenue est confiée à un prestataire extérieur, ce doit être un expert-comptable inscrit à l’Ordre.
Logiciel de facturation et logiciel de comptabilité : quelle différence ?
Le premier crée et suit les documents commerciaux. Le second organise les écritures, journaux, comptes, taxes et états. Certaines suites couvrent les deux, mais il faut vérifier la continuité réelle.
Mon logiciel de comptabilité doit-il être une plateforme agréée ?
Pas forcément. Depuis le 1er septembre 2026, votre entreprise doit pouvoir recevoir ses factures électroniques par une plateforme agréée, et l’émission deviendra obligatoire pour les PME et micro-entreprises le 1er septembre 2027. Le logiciel peut être lui-même immatriculé ou se connecter à une plateforme : vérifiez son statut sur la liste de l’administration fiscale.
Combien coûte un logiciel de comptabilité pour une TPE ?
Les prix relevés le 29 septembre 2026 vont d’une offre gratuite (Indy, Tiime, une application Odoo) à des plans payants dès 7 € HT par mois chez Pennylane ou 21 € HT par mois pour le pack Comptabilité de Sage 50 ; EBP est sur devis. Pour une société, le bilan est souvent payant à part : chez Indy, il est inclus dès 49 € HT par mois en facturation annuelle.
Quelles données exporter avant de changer de logiciel ?
Exportez le fichier des écritures comptables (FEC), les balances, journaux, pièces, fiches clients et fournisseurs, immobilisations, plan de comptes et rapprochements, puis faites contrôler un exercice et les soldes d’ouverture.
En résumé
Choisissez d’abord selon votre statut et votre relation avec le cabinet. Testez Pennylane si votre expert-comptable y travaille déjà, Indy si vous voulez produire vous-même votre bilan avec un parcours guidé, et Sage 50 ou EBP si la gestion commerciale et les stocks pèsent lourd.
Contrôle final : avant de signer, vérifiez le statut de plateforme agréée de l’éditeur et testez un export complet de vos écritures.
Testez Rappli sur un appel manqué
Après un appel manqué renvoyé vers Rappli, votre client peut recevoir un SMS avec un lien vers un formulaire ou avec votre propre message, si son numéro et vos réglages le permettent.
Essayer Rappli gratuitementJusqu’à 30 jours (30 SMS avec formulaire ou 100 SMS personnalisé), sans engagement. Moyen de paiement demandé à l’inscription. Détails de l’essai.